Районът е богат на водни ресурси и има уникални минерални извори. В близост преминава р. Струма, а през самия град минава р. Банищица.
Градът е център на лека и преработваща промишленост: дърводобив, производство на обувки, трикотаж, конфекция, детски играчки, опаковки, хлебопроизводство, печатарство и консервна промишленост. Има предприятия за производство на кондензатори, силови трансформатори, битово и кухненско обзавеждане и дограма. През последните години се развиват хотелиерството и туризма. Района има традиции в овощарството и търговията с пресни и сушени плодове. Кюстендил е център на земеделски район с вековни традиции в областта на овощарството, поради което градът и околностите му са известни като „овощната градина на България“.
За областта през 2018 г. БВП на човек от населението в лева е 9 285.